奶茶店员工没干满半年要扣1000元培训费，这合理吗？

不合理，公司无故扣除员工培训费违法。依据《劳动合同法》，专项培训才可约定服务期及违约金，且违约金不得超培训费。若公司强制扣除，将损害员工权益，影响员工工作积极性及公司声誉。
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扣培训费不合理。处理如下：1.查看合同，确认是否有培训服务期约定；2.若无约定或培训非专项，拒绝扣费，可申请劳动仲裁；3.若有约定且违约，需按约定支付违约金，但不得超培训费。
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公司扣培训费需视情况而定。若属专项培训且约定服务期，员工违约时可扣。若无约定或非专项培训，不得扣除。选择处理方式时，应先了解培训性质及合同内容。